南蘇丹首都朱巴是南航空樞紐，提供國(guó)內(nèi)、國(guó)際民航、貨運(yùn)和商業(yè)包機(jī)服務(wù)。目前朱巴有往返蘇丹首都喀土穆、埃塞俄比亞首都亞的斯亞貝巴、肯尼亞首都內(nèi)羅畢、阿聯(lián)酋迪拜、烏干達(dá)首都坎帕拉、埃及首都開羅、盧旺達(dá)首都基加利的國(guó)際航班。國(guó)內(nèi)主要城鎮(zhèn)設(shè)有簡(jiǎn)易機(jī)場(chǎng)，運(yùn)營(yíng)國(guó)內(nèi)航線。

朱巴國(guó)際機(jī)場(chǎng)主要國(guó)際航線如下：

1、朱巴-內(nèi)羅畢航線

2、朱巴-亞的斯亞貝巴航線

3、朱巴-喀土穆航線

4、朱巴-迪拜航線

5、朱巴-坎帕拉航線

6、朱巴-開羅航線

7、朱巴—基加利航線

南蘇丹各州間有長(zhǎng)途客車，但車輛陳舊，道路多為土路，路況差，雨季期間不少道路無(wú)法通行。朱巴至尼穆勒（臨近烏干達(dá)的邊境城市）的跨境公路是目前南商品進(jìn)出口的主要通道。

南蘇丹為內(nèi)陸國(guó)，尼羅河是其境內(nèi)唯一水路航道。內(nèi)河航運(yùn)可自朱巴一直北上，直抵蘇丹喀土穆。目前無(wú)法通航。

南蘇丹首都朱巴無(wú)公交系統(tǒng)，僅有民營(yíng)的各式面包車往返載客，車況差，事故頻發(fā)。當(dāng)?shù)厝硕噙x用被稱為“Boda Boda”的個(gè)人營(yíng)運(yùn)摩托車作為市內(nèi)交通工具。

朱巴：南蘇丹首都，中央政府所在地，同時(shí)也是中赤道州首府。人口約50萬(wàn)，平均海拔457米，距蘇丹首都喀土穆1198公里，距烏干達(dá)邊境約180公里，尼羅河流經(jīng)城市東側(cè)。

瓦烏：南蘇丹第二大城市，西加扎勒河州首府，位于朱爾河岸，人口約14萬(wàn)。瓦烏是南西北地區(qū)農(nóng)產(chǎn)品和畜產(chǎn)品集散地，重要交通樞紐。